Vergi müfettişi ya da yetkili başka bir kişi tarafından kendisine verilen sorumlulukları yerine getirmekle yükümlü olan vergi müfettiş yardımcısının başlıca görevleri şunlardır:

• Vergi mevzuatı ve yükümlülükleri çerçevesinde şirketlere, kuruluşlara, ortaklık ya da kişilere mevzuatı uygulamak,
• Dolandırıcılık hakkında araştırma yapmak ve rapor düzenlemek,
• Şirket, kuruluş, şahıs hesaplarını incelemek,
• Vergi mevzuatları ve değişiklikleri konusunda ortaklara şirketlere ve kuruluşlara uzman tavsiyelerde bulunmak,
• İtiraz edilen davalar olduğu zaman, Maliye Bakanlığı'nın bağım temyiz mahkemelerinde bulunmak,
• İşletmenin doğru işleyişini tespit edip anlamak adına işletmenin mali denetimini yapmak,
• Vergi hukukunun doğru uygulanıp uygulanmadığını görmek adına ticari hesap kontrolleri yapmak,
• Muhasebeci, vergi mükellefi ve avukatlar ile vergi konusunu tartışmak,
• Kayıtları incelerken, yönetim kurulundaki kişilerin yaşam tarzlarını da göz önünde bulunduracak araştırmalar yapmak,
• Soruşturma için iş yeri ziyaretleri yapmak,
• Vergi hukuku, mevzuatı konularında günceli takip etmek.